将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！　　这时，纽约市中发生一连窜的怪在视听处理上，导演有意淡化戏剧冲突。数字修复为历史影像带来革新，全彩上色让历史更加鲜活，画面呈现拓展表现空间。但技术使用十分克制，整体色彩保持历史本色。整体表现注重意义深度。色彩选择体现历史责任感，声音设计追求简约效果。。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织FootClan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！　　神龟们又处于备战状态了！他们再次联合起来，准备向黑暗势力出击！